Ve školním roce 2020/21 odstartoval v Bratrské škole II. stupeň. Ve školním roce 2023/2024 je škola kompletní od 1. do 9. třídy s průměrným počtem 21 dětí ve třídě. Těšíme se na budovu nové školy, jejíž plánování stále probíhá.
Rozhodnutím synodu v květnu 2021 bude v nové budově umístěna také střední škola Evangelické akademie, která nyní sídlí na Praze 4.